Der prägnante romanische Turm ist noch ein Zeugnis aus dieser Zeit.Die Kirche bewahrt Mirakelbilder der "Neubeurer Wunder".
Im Jahre 1498 war das sogenannte Glöckleinwunder: Dies ereignete sich am Abend des hl. Märtyrers Sebastian, als zu dieser Zeit die Kirchen und der Glockenturm in "Neybeiern" versperrt waren, läutete doch die kleine Glocke im Turm. Viele Marktbewohner wachten dadurch auf und suchten den Kirchenturm ab, aber keiner war zu finden. Noch heute wird die "Gnadenglocke" einmal im Jahr am 4. Fastensonntag zu Wandlung und Andacht geläutet.
1512 war ein weiteres Wunder, das Lichtwunder: In der Karfreitagsnacht, als die Kirche wieder versperrt war, wurde ungefähr um Mitternacht, ein großes ungewöhnliches Licht in der Kirchen gesehen. Nun dachten die Marktbewohner, dass es in der Kirche brenne, jedoch als man aufsperrte, sei das Licht verschwunden.
Die "Neubeurer Wunder" wurden später vom Erzbischöflichen Ordinariat in Salzburg untersucht und bestätigt.